Panels-kentässä on joukko ohjelman apuikkunoita. Osa ikkunoista voidaan telakoida osaksi näkymää tai sitten kellumaan päänäkymän päällä. Tällaisia ovat Mixer, Keyboard, Fretboard ja Ideas. Loput ikkunat ovat pelkästään kelluvia. Alla olevassa ikkunassa Ideas on telakoitu näkymän vasempaan reunaan ja Keyborad kelluu nuottien päällä.
Telakoidun ikkunan saa kellumaan sen vasemmassa yläkulmassa olevasta painikkeesta. Telakointi tapahtuu vetämällä ikkuna lähelle sen telakointireunaa. Esimerkiksi Ideas vedetään ikkunan vasempaan reunaan ja Mixer alareunaan.
Keypad- ja Navigator-ikkunat on esitelty oppaan johdanto-osassa. Mixer-ikkuna esitellään Play-valikon yhteydessä. Transport-ikkunan tärkeimmät toiminnot voidaan hoitaa näppäinoikotein. Näistä on kuvaus Play-valikon oppaassa. Pari asiaa on kuitenkin hyvä tietää:
Ikkunan sinisessä kentässä ilmaistaan soittokohta (Playback Line): tunnit, minuutit, sekunnit ja framet sekä tahdit ja tahdinosat. Lisäksi siinä on tempon metronomilukema. Kentän oikealla puolella olevasta liukusäätimestä voi muuttaa tempoa.
Sinisen kentän yläpuolella on pitkä liukusäädin, jolla voi siirtää nopeasti soittokohtaa kappaleen eri osiin.